Decyzja Prezesa Urzędu Ochrony Danych Osobowych może być zaskarżona skargą do Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego. Skargę do WSA wnosi się za pośrednictwem Prezesa Urzędu Ochrony Danych Osobowych, a więc w pierwszej kolejności skarga jest adresowana do Prezesa UODO, który może uwzględnić skargę i wydać nową decyzję, bądź odmówić jej uwzględnienia i przekazać skargę do WSA.
Skargę należy wnieść w terminie 30 dni od otrzymania decyzji. Skarga powinna czynić zadość wymaganiom pisma w postępowaniu sądowym, a ponadto zawierać wskazanie zaskarżonej decyzji i organu, który ją wydał, oraz określenie naruszenia prawa lub interesu prawnego (art. 57 § 1 p.p.s.a.).